İnn-i Cin Mişna, cinlerle bağlantısı olan bir kadının yıllar sonra onlarla yeniden irtibata geçmesiyle yaşananlara odaklanıyor. Genç yaşta cinlerle işbirliği yaptığı için ailesiyle birlikte cezalandırılan Münire, aradan geçen yılların ardından nefsine yenik düşer ve yeniden cinlerle anlaşma yapar. Bunun için de Münire’nin birini seçmesi gerekmektedir. O da, müdirelik yaptığı tiyatronun oyuncusu olan ve kısa sürede ekibin güvenini toplayan Samet’i seçer. Samet’e bir plan hazırlayan Münire, işleri istediği gibi gitmediği için Samet’e cinlerin musallat olmasına neden olur. Gittikçe işler içinden çıkılmaz bir hal alır ve bunu önleyebilecek tek kişi küçükken dedesinden el alıp iyi huylular tarafından korunan Murat’tır.
